Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms