Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX16O60231 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DHX16O60231 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX16O60231 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms