Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms