Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms