Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms