Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASKO14936 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASKO14936 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASKO14936 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASKO14936 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms