Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TSPAN4O14817 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TSPAN4O14817 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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