Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms