Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms