Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPA5E9PKD4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms