Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms