Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A8MVJ9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A8MVJ9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A8MVJ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A8MVJ9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms