Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms