Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms