Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms