Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms