Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SFI3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms