Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
FOXD1Q16676 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms