Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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