Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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