Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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