Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
NWD1Q149M9 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
NWD1Q149M9 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms