Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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