Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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