Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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MKRN4PQ13434 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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MKRN4PQ13434 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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MKRN4PQ13434 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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MKRN4PQ13434 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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MKRN4PQ13434 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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