Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms