Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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HOXD11P31277 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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