Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms