Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms