Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNSTRNQ9Y448 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms