Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms