Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms