Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms