Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms