Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR1DQ9Y2S0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms