Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL20Q9Y2M5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms