Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms