Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNND2Q9UQB3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms