Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms