Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms