Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms