Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms