Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCTN4Q9UJW0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms