Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms