Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH4Q9UIA0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH4Q9UIA0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms