Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms