Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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