Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms