Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms