Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms